dna一根头发

广州亲子鉴定中心 2个月前 (04-16) 阅读数 13 #亲子鉴定费用

dna一根头发

大部分医院是没有做DNA亲子鉴定的,但是当地的亲子鉴定中心可以做》》》点击获取当地中心地址电话

一、一根头发做dna

DNA甲基化是更早被发现、也是研究更深入的表观遗传调控机制之一。个被发现的5-甲基胞嘧啶(5mC)是研究更多的修饰碱基,它在从基因调控到正常发育的广泛生物过程中发挥着重要作用,被认为是第五个碱基。5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)是由5mC经过TET家族酶氧化而来,在神经元细胞含量较高,被认为是第六碱基。

DNA甲基化修饰在维持正常细胞的功能、雌性个体X染色体失活、寄生DNA序列的抑制、基因组结构稳定、遗传印记、胚胎发育、及肿瘤和疾病的发生、发展紧密相关,具有至关重要的作用。

5mC可以导致基因沉默或基因表达水平降低,因此,肿瘤抑癌基因的过甲基化或原癌基因的低甲基化在多种肿瘤中被发现。而5hmC作为去甲基化过程的步,则会导致基因激活或基因表达水平增高,研究表明DNA的5hmC在多种肿瘤中有明显降低。因此,分析基因组的5mC和5hmC水平具有重要的临床意义。

WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing)被视为甲基化测序的“金标准”,主要检测5mC和5hmC两种修饰形式。在此基础上衍生出了的一些方法用来分5mC和5hmC,比如氧化亚硫酸氢盐测序(oxBS-seq)被用于5mC特异性测序,以及TET辅助的重亚硫酸盐测序(TAB-seq)特异性检测5hmC。

近年来,基于酶法转化的甲基化测序技术不断涌现出来,APOBEC偶联甲基化表观测序 (ACE-seq)可以特异性检测5hmC,以及酶法甲基化测序(EM-seq)可同时检测5mC和5hmC。TAPS技术一改之前将未发生甲基化修饰的C转化未U的方法,创新性的实现了正向检测甲基化位点的测序技术,其衍生技术TAPSβ及CAPS,亦可实现5mC和5hmC的分,具有巨大的潜力。

一、氧化亚硫酸氢盐测序oxBS-seq

该技术在将传统的BS-Seq技术与化学氧化相结合,先利用高钌酸钾KRuO4将DNA上的5hmC氧化成5fC,再用重亚硫酸盐处理,5fC和没有任何修饰的C就被转化成U,而5mC则不会被转化,仍然保持为C。如此则可以特异性的检测5mC,BS-Seq和oxBS-Seq联合测序也可实现对5hmC单碱基分辨率的检测。

其技术原理示意图如下(图1):

图1、oxBS-seq 5mC单碱基分辨率测序(Booth, M。 J。 et al.2012, Science)

二、TET辅助的重亚硫酸盐测序(TAB-seq)

用糖基把羟甲基化的C给保护起来,然后用TET蛋白(Ten-eleven translocation methylcytosine dioxygenase 1),把甲基化的C转化成羟基化的C,进一步将羟甲基化的C转化成甲酰化的C和羧基化的C。甲酰化的C和羧基化的C都可以被亚硫酸氢盐转化成U。而之前被糖基化保护起来的羟甲基化的C,是不会被TET蛋白转化成甲酰化的C或者羧基化的C的。在亚硫酸氢盐的处理过程中,它还保持是C。并且在之后的PCR扩增产物中,也表现为C。这样,就可以把羟甲基化的C和甲基化的C给分开来,从而特异性的检测5hmC。

其技术原理示意图如图(图2):

图2、TAB-seq 5hmC单碱基分辨率测序 (Yu, M。 et al。 2012, Cell)

三、APOBEC偶联甲基化测序(ACE-seq)

不同于传统的BS-Seq,该技术使用AID/APOBEC家族DNA脱氨酶APOBEC3A (A3A)代替化学脱氨,保证了DNA的完整性。首先,利用T4 β-葡糖基转移酶(βGT)将5hmC转化成5ghmC,5ghmC不会被A3A酶脱氨基,这样A3A能够特异地脱去C及5mC的氨基使其变为U,而5ghmC则因为不被该酶识别,测序时仍被检测为C。这样,可将5hmC与C及5mC分开来,实现特异性检测5hmC。

该技术原理示意图如下(图3):

图3、ACE-seq 5hmC单碱基分辨率测序(Schutsky, E。 K。 et al。 2018, Nat。 Biotechnol)

四、酶法甲基化测序(EM-seq)

全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)长期以来一直是甲基化图谱分析的金标准,但重亚硫酸盐的化学反应会破坏和降解DNA,导致DNA断裂和丢失。基于酶法的甲基化测序就克服了这个缺点。

Enzymatic Methyl-seq(EM-seq)通过酶法完成WGBS建库,其对DNA的酶处理分为两步:步使用TET2酶以及氧化增强剂将5mC和5hmC氧化成5caC,保护经过修饰的胞嘧啶;第二步利用脱氨酶APOBEC对胞嘧啶进行脱氨处理,此步骤不会对5caC造成影响,从而实现5mC和5hmC的检测。

其技术原理示意图如下(图4):

图4、EM-seq 单碱基分辨率测序(Vaisvila, R。 et al.2020, bioRxiv)

五、TET辅助吡啶硼烷测序(TAPS)(TET-assisted pyridine borane sequencing)、TAPSβ及CAPS

在TAB-seq中讲到TET蛋白可以把甲基化的C转化成羟基化的C,进一步将羟甲基化的C转化成甲酰化的C和羧基化的C。TAPS技术发现5caC可以被吡啶硼烷及衍生物(Pyridine borane)还原为二氢尿嘧啶(dihydrouracil,DHU),而DHU在链扩增方面与自然的U碱基并没有差异,这样经过PCR扩增DHU可以转化为T,从而到达不用亚硫酸盐处理将甲基化的C碱基转为T碱基的目的。TAPS得到的DNA文库复杂度高(仅把占比很小的甲基化C进行了改变,对DNA的天然序列改变很小,碱基平衡),避免了bisulfite法引起的DNA损伤及文库的不平衡,对Illumina测序仪更加友好,数据质量较高。

TAPS的衍生方法TAPSβ及CAPS可分别用于检测5mC和5hmC。TAPSβ也是用糖基化酶把羟甲基化的C给保护起来,使其免受TET氧化。再使用TET酶将甲基化的C转化羟甲基化的C在转化成甲酰化的C和羧基化的C。5caC则可在吡啶硼烷还原为二氢尿嘧啶,而被保护起来的羟甲基化的C则不变。经过后续步骤测序则可特异性的分5mC。CAPS技术仍利用利用了oxBS-seq中高钌酸钾KRuO4将DNA上的5hmC氧化成5fC,经吡啶硼烷的衍生物(pic-borane)5fC还原成二氢尿嘧啶,从而实现特异性的检测5hmC。

该系列技术原理示意图如下(图5):

图5、TAPS、TAPSβ、CAPS 单碱基分辨率测序(Liu, Y。 et al.2021, Nat Commun)

参考文献:

[1] Booth, M。 J。 et al。 Quantitative sequencing of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine at single-base resolution。 Science 336, 934–937 (2012)。

[2] Yu, M。 et al。 Base-resolution analysis of 5-hydroxymethylcytosine in the mammalian genome。 Cell 149, 1368–1380 (2012)。

[3] Schutsky, E。 K。 et al。 Nondestructive, base-resolution sequencing of 5-hydroxymethylcytosine using a DNA deaminase。 Nat。 Biotechnol。 36,1083–1090 (2018)。

[4] Vaisvila, R。 et al。 EM-seq: detection of DNA methylation at single base resolution from picograms of DNA。 Preprint at bioRxiv doi。org/ 10.1101/2019.12.20.884692 (2020)。

[5] Liu, Y。, Hu, Z。, Cheng, J。 et al。 Subtraction-free and bisulfite-free specific sequencing of 5-methylcytosine and its oxidized derivatives atbase resolution。 Nat Commun 27;12(1):618(2021)。

二、一根头发能不能做基因检测

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—THE END —

三、DNA一根头发可以吗

亲子鉴定随便用一根头发可以做吗?当然是不行的,头发是可以用来做dna亲子鉴定,但是需要是带有毛囊的头发3-5根。一般脱落的头发是不带毛囊的,因此是不能用作鉴定样本的。采集头发样本,需要从头上直接拔下来,头发根部有一段白色毛囊,这样才能做为合格样本。做鉴定的材料很多常用的是血痕、带毛囊的毛发、口腔拭子;身体其他组织也可以,比如骨骼、牙齿、肌肉等等。

头发做dna亲子鉴定样本如何采集?

(1)用手抓住距离毛发根部较近的地方,用力拔下至少4-5根头发(毛发末端可以看到清晰的白色物质,即毛囊)。

(2)拔下的毛发更好在温下干燥几分钟后放在干净无香味的餐巾纸上,再装入信封内,信封上标注被鉴定人信息。

(3)为了保证检测的结果和质量,请勿邮寄自然脱落、剪下或者拔下来超过2-3周的毛发。

(4)注意将每个样本单独放置,不能相互接触!

DNA亲子鉴定使用头发准确吗?

使用头发做DNA亲子鉴定和血样做DNA亲子鉴定准确率是一样的。而且DNA鉴定中心亲子鉴定中心采用进口仪器和试剂盒,准确率达到99.9999%以上。DNA鉴定中心亲子鉴定中心技术人员除采用更先进的ABI 3500基因遗传测序系统外,还会对同一样本检测2次以上,对否定样本检测3次以上,对DNA样本留样3个月,使确认的亲权指数可高达99.999%以上,非亲排除率100%。

采集毛发

拔5根-8根头发(白发或黑发均可),根部带有毛囊(白色或黑色物质),阴干后用纸包起即可。

亲子鉴定是运用医学、生物学和遗传学的理论和技术,从后代和父母的形态结构或生理功能的相似特征来分析遗传特征,判断父母和子女是否存在生物学关系。

常规样品的检测包括以下步骤(这里以毛细管电泳仪和荧光标记试剂盒为例):步:提取样品细胞核中含有的DNA,纯化去除样品中的杂质;第二步:通过酶促反应,将待测DNA片段放大到专用仪器可以清晰看到的程度;第三步:打开DNA双螺旋结构的双链,加入一些内标进行检测。检测片段的长度步骤4:毛细管测序仪检测。根据DNA的一定电荷,毛细管电泳不同片段长度的DNA电泳速度会有所不同,在相同电荷和相同电泳时间下,游动距离也会有所不同。这些不同长度的距离可以分别用前期增加的内标测量来标注,同时可以通过一定的软件显示在电脑上。便于检验人员处理和分析数据。第五步:检验人员将对获得的结果进行分析、总结和计算,然后给出鉴定结论和报告。这就是DNA亲子鉴定的全过程。常规检查样本(如血痕、毛发、口腔拭子等。)一般需要7个工作日才能得到准确的鉴定结果,而特殊样本(牙齿、肌肉等。)需要将日出结果延迟十到十五个工作日。

我们中心实验的每一个样本都是由两组实验人员进行检测,将获得的数据进行比对后才能出具报告。

同时,对于基因位点突变或近亲间DNA鉴定等特殊情况,我中心还配备了多种基因检测试剂盒,检测位点可达20-28个,确保检测结果的准确性。

如客户急需了解结果或公安机关需要破案,我中心提供加急服务,可选择加快至两个工作日或三个工作日。

然而,在这种情况下,至少有两名鉴定人员连夜加班。

四、一根头发测的dna准吗

建议弄个五六根,一根太少。

毛发采样方法

1准备工作

准备好干净的白纸、信封

2采样步骤

1、用手抓住毛发根部,用力拔下至少5根头发(毛发末端可看到清晰的毛囊,即毛发根部白色或黑色物质)。

2、拔下的毛发在温条件下干燥几分钟(刚采下的毛囊粘性较大),再用干净的纸包好装入信封。

3、将不同的样本单独放置,注意不能相互接触,放入不同的纸信封中,信封上标记清楚样本所属人的身份和姓名。

3注意事项

1、不要触及毛发的毛囊部位,就是您看到的毛发根部的白色物质;

2、为保证检测效果,请勿寄送自然脱落下来的毛发,或者拔下来放置很久的毛发。

4方法优点

1、不受时间、地点限制,是很简便的取样方法,且隐蔽性高。

2、利用毛发作亲子鉴定的精确度与采血等取样方法一致。[收起]

以上关于“dna一根头发”的全部内容了,想要了解更多亲子鉴定相关资讯,请继续关注成之嘉生物。

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